Graphique en fonction du pourcentage de similarité

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Grendel26
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Graphique en fonction du pourcentage de similarité

par Grendel26 » 13 Oct 2016, 16:21

Bonjour, je vous explique mon problème :

J'ai 4 points:
Large deep
Large littoral
Small deep
Small littoral
Qui correspondent donc à des habitats. Mon sujet concerne celui du diet overlap entre chaque habitat, et small signifie les petites poissons et je vous le donne en mille Large signifie les grand!

Pour le coup ça donne un tableau avec par exemple Large deep versus Small deep = 0,29 %
Je me retrouve donc avec six résultats.

La ou je bloque c'est que j'ai besoin de faire un graphique avec six points, correspondant donc à chacun de mes habitats avec la taille qui va avec.
Et établir une relation entre chaque point, ici dans ce cas je voudrai alors éloigner le plus possible Large deep de Small deep puisque le diet overlap est tout petit et par exemple un diet overlap de 0,78, je voudrai rapprocher ces deux points.

Je sais le faire manuellement, c'est tout bête mais j'aimerai le faire avec un outil informatique, ou bien en utilisant R ou excel, mais je ne connais pas de nom de modèle mathématique qu'il faut utiliser sur R ou excel.

Si quelqu'un pourrait m'aider à trouver un graphique pour créer des liens entre chaque points en fonction de leur pourcentage d'identité ça serait cool.

Merci !!! :D



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Ben314
Le Ben
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Re: Graphique en fonction du pourcentage de similarité

par Ben314 » 13 Oct 2016, 17:20

Salut,
Si je comprend bien le problème, tu voudrait représenter, dans le plan affine Euclidien (i.e. sur une feuille de papier donc un truc plat et pas dans l'espace ambiant de dimension 3) 4 points A,B,C,D tels que les 6 distances AB,AC,AD,BC,BD,CD soit proportionnelle à 6 valeurs données d'avance (un truc plus ou moins égal à l'inverse des pourcentages si j'ai bien compris)

Bon, ben si c'est ça, ça va clairement coincer : avec 3 points A,B,C et les 3 distances AB,AC,BC, tu as pas trop le choix de la représentation, et encore, il faut que la plus grande des 3 valeurs soit inférieur à la somme des deux autres (=tracé d'un triangle dont les longueur des cotés sont connus).
Ensuite, pour le point D, le fait que DA=connu et DB=connu signifie que, sur ta figure, c'est un des deux points d'intersection de deux cercles centrés respectivement en A et B (modulo que les cercles en question se coupent effectivement). Donc avec un peu de pot, il y aura 2 points D qui vérifient DA=... et DB=...
Mais arrivé à ce point, il est extrêmement peu probable qu'un des deux points en question vérifie la 6em contrainte, à savoir DC=connu.
Bref, quasi systématiquement, tu aura pas de solution à ton problème et il faudra rectifier le tir :
- Soit en acceptant que ça soit "pas exactement" proportionnel mais dans ce cas, pour un traitement mathématique, il faut s'entendre sur le sens du "pas exactement" (souvent on veut que je_sais_pas_quoi soit le plus petit possible)
- Soit en faisant ton dessin dans R^3 et pas dans R^2...
Qui n'entend qu'un son n'entend qu'une sonnerie. Signé : Sonfucius

Grendel26
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Re: Graphique en fonction du pourcentage de similarité

par Grendel26 » 13 Oct 2016, 18:37

Ben314 a écrit:Salut,
Si je comprend bien le problème, tu voudrait représenter, dans le plan affine Euclidien (i.e. sur une feuille de papier donc un truc plat et pas dans l'espace ambiant de dimension 3) 4 points A,B,C,D tels que les 6 distances AB,AC,AD,BC,BD,CD soit proportionnelle à 6 valeurs données d'avance (un truc plus ou moins égal à l'inverse des pourcentages si j'ai bien compris)

Bon, ben si c'est ça, ça va clairement coincer : avec 3 points A,B,C et les 3 distances AB,AC,BC, tu as pas trop le choix de la représentation, et encore, il faut que la plus grande des 3 valeurs soit inférieur à la somme des deux autres (=tracé d'un triangle dont les longueur des cotés sont connus).
Ensuite, pour le point D, le fait que DA=connu et DB=connu signifie que, sur ta figure, c'est un des deux points d'intersection de deux cercles centrés respectivement en A et B (modulo que les cercles en question se coupent effectivement). Donc avec un peu de pot, il y aura 2 points D qui vérifient DA=... et DB=...
Mais arrivé à ce point, il est extrêmement peu probable qu'un des deux points en question vérifie la 6em contrainte, à savoir DC=connu.
Bref, quasi systématiquement, tu aura pas de solution à ton problème et il faudra rectifier le tir :
- Soit en acceptant que ça soit "pas exactement" proportionnel mais dans ce cas, pour un traitement mathématique, il faut s'entendre sur le sens du "pas exactement" (souvent on veut que je_sais_pas_quoi soit le plus petit possible)
- Soit en faisant ton dessin dans R^3 et pas dans R^2...


Je ne pensais pas que c'était aussi compliqué, je me rappel que l'un de mes profs avait un logiciel, il n'avait que à entre les valeurs entre chaque points, puis le logiciel lui dessiné les relations sur un plan comme tu disais.
Yep, c'est bien ça, mais l'importance de la précision m'importe guère, si les valeurs ne sont pas exactement proportionnelles ce n'est pas grave, je veux juste que mes données parlent juste en regardant le dessin entre chaque points.
Je n'ai pas bien compris, existe-t-il un logiciel pour faire ça ?
Merci de ton aide.

 

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