Petite question

par **smilou** » 24 Fév 2007, 16:05

bonjour, je cherche a faire 1 tableau de comparaison en pourcentage de similitude d'acide aminés en prenant une séquence de référence mais lorsque 1 protéine est écourtée (codon stop) le pourcentage se calcule t'il sur le nombre d'acide aminés qui devraient etre présent ou uniquement sur ceux que l'on a jusqu'au codon stop??

par **farator** » 24 Fév 2007, 19:47

Le pourcentage se calcule uniquement sur ceux que l'on a jusqu'au codon stop, je pense. Le codon stop n'est pas un acide aminé en soi, un peu comme la méthionine initatrice coupée. C'est juste un code pour pour identifier la fin de la séquence.

par **quantum** » 24 Fév 2007, 22:37

ce que tu dis farator est absolument frais en faite le codon stop n'est jamais traduit en acide aminé.Il n'ya meme pas d'equivalence.c'est claire donc on calcule uniquement tout ce qui va donner des acides aminés qui forment une protéine.

par **S@m** » 24 Fév 2007, 22:38

Salut ;)

Pour info, la methionine est très souvent compté :++:
Par contre le codon stop jamais, pour la simple et bonne raison qu'il ne code pas pour un acide aminé.

par **quantum** » 24 Fév 2007, 22:54

S@m a écrit:Salut

Pour info, la methionine est très souvent compté :++:
Par contre le codon stop jamais, pour la simple et bonne raison qu'il ne code pas pour un acide aminé.

j'ai bien dis que le codon stop n'est jamais traduit ,donc on le compte jamais

lis bien STP

par **S@m** » 24 Fév 2007, 22:56

Je répondais a la premiere question

par **farator** » 25 Fév 2007, 16:44

Moué moi je ne suis pas du tout convaincu que la méthionine initiatrice soit comptée, vu qu'elle est coupée ...

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